不违法，工资分两次发需公司与员工协商一致。依据《劳动法》规定，工资支付需按约定日期进行，若双方有约定则合法。未及时支付或未足额支付，可能面临法律责任。
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常见处理方式为：与公司沟通确认工资发放方式，并签订书面协议。或向劳动监察部门咨询，确保合法合规。选择方式时，应优先考虑与公司协商，确保双方意见一致，避免纠纷。
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处理方式如下：1. 与公司协商，明确工资分两次发放的具体安排，并签订书面协议，确保合法性。2. 如公司不同意，可咨询劳动监察部门或律师，了解自身权益及合法工资支付方式。3. 在未达成一致时，考虑通过法律途径维护权益，避免公司违法操作带来的不良影响。